Nel giorno delle nozze di Borisov al trono, i boia calcolano i frutti del suo regno: la pestilenza repressa, le guerre completate e i raccolti. Sono stupiti da quanto Godunov ha dovuto convincerlo a prendere il potere, e solo la minaccia della scomunica lo ha costretto a farlo. Boris ritorna dalla cattedrale, con l'intenzione di ricevere ambasciatori. Voeikov annuncia la vittoria sul siberiano Khan. L'ambasciatore inglese offre la sposa a Tsarevich Fedor; nunzio papale - un accordo sull'unificazione delle chiese; Gli ambasciatori austriaci, lituani, svedesi e fiorentini chiedono rispettosamente qualcuno con denaro o truppe, che riconoscano i loro averi. Gli ambasciatori persiani e turchi si accusano a vicenda di aver aggredito Iberia, l'ambasciatore del re iberico chiede protezione. Lo zar dà una risposta adeguata a tutti, pieno di dignità e forza, e ordina a tutti di essere ammessi nelle camere reali ("Non c'è barriera tra il popolo russo e lo zar!"). Rimasto solo, Boris trionfa e, ricordando la morte del principe, decide: quindi l'inevitabile prezzo per la grandezza dello stato. Poco dopo, mentre aspettava nella cella del monastero che Irina si tagliasse i capelli, Boris ascolta le notizie di Semyon Godunov sui Romanov, che non sono contenti della cancellazione del giorno di San Giorgio; contro Vasily Shuisky, un servo astuto e inaffidabile, ma fiducioso della sua forza, non vuole punire nessuno. Appare Irina e Boris, ricordandole le sue vacillazioni sulla via del potere, chiede di giustificarlo e ammettere che la prosperità della Russia vale la falsità attraverso la quale divenne re. Irina, approvando il suo regno, chiede di non dimenticare la propria colpa e di non perdonare se stesso. Lasciati con i loro, si separano.
Nel palazzo, i bambini di Boris, Fyodor e Xenia ascoltano le storie di Christian, il duca danese, il fidanzato di Xenia - sull'infanzia dura, sul ritorno in tribunale, sulle battaglie nelle Fiandre con le truppe spagnole, ma quando Fedor si lamenta della sua pigrizia, Christian nota che la sua posizione, che gli consente di studiare la regola sotto un saggio sovrano, è molto più degna. Christian racconta come amava la Ksenia secondo le storie di ambasciatori, mercanti e prigionieri, che glorificavano insieme alla grandezza della Russia la bellezza, l'intelligenza e la mansuetudine della principessa. Cominciano a parlare di Boris e tutti concordano nell'amore per lo zar, che si dimentica della gloria e del benessere dello stato. Tutti e tre giurano di aiutarsi a vicenda. Christian chiede a Boris, che entrò, in caso di guerra, di permettere alle truppe russe di guidare, ma lo zar è scoraggiato dalla pace che è arrivata per molti anni. I bambini se ne vanno e Semyon Godunov, che è venuto, annuncia una voce sul principe meravigliosamente salvato Dimitri. Nelle sue stanze, la zarina Maria Grigoryevna chiede all'impiegato Vlasyev del cristianesimo e, non importa come sia Juliet Vlasyev, scopre che c'era la sensazione che il re non fosse suo padre, e che suo fratello maggiore, che ora regna, non gli piacesse. Non avendo promesso all'impiegato di testimoniare a Boris, chiama Dementyevna e con crescente irritazione scopre che Ksenia era seduta con suo fratello e lo sposo e lo zar accoglie le nuove usanze. La Tsarina che venne a Volokhov si lamenta che Boris afferrò Ksenia per i tedeschi senza chiederglielo, e apparentemente i tedeschi accesero la principessa. Volokhov si impegna a divinare qual è la forza del cristiano e schiacciarlo ("C'è una tale radice"). Nella foresta, nel campo dei rapinatori, Ataman Khlopko accetta il nuovo rifornimento dei contadini, maledicendo Boris e l'abolizione del giorno di San Giorgio. Appare un Posadsky che, senza alcuna paura, chiede di liberare i suoi compagni catturati sulla strada di Mosca da una sentinella rapinatrice, e riporta le vere notizie sulla comparsa di Tsarevich Dimitri. Posadsky picchia Khlop per andare a Bryansk e lì, dopo aver molestato le truppe dello tsarevich, riceve il perdono e combatte Godunov. Compare Mitka, trascinando due monaci in fuga, Mikhail Povadin e Grishka Otrepyev, che chiedono di arruolarsi nell'esercito del cotone. Quando Posadsky, dopo aver divertito i ladri combattendo con Mitka e ordinando di stendere barili di vino, scompare improvvisamente, si scopre che i monaci che camminavano con lui non sanno chi sia.
Boris è costretto ad ammettere che l'emergere di un nuovo nemico lo ha spinto su una strada sanguinante. Semyon Godunov, accusato di scoprire chi si nasconde dietro il nome di Demetrio, afferma di non sapere nulla a spese della tortura. Cercano il nome di Grishka Otrepyev, un monaco miracoloso fuggitivo, per in qualche modo rinominare il nemico. Boris ordina di moltiplicare le spie e trovare prove sui Romanov e, inoltre, a causa della fame in corso, distribuisce il tesoro al popolo, ordinandogli di non ascoltare le favole sul principe. Tsarevich Fedor chiede di inviarlo alle truppe, Tsarevna Ksenia piange il cambiamento di Boris e la sua crudeltà; Un cristiano chiede se Boris è sicuro della morte di Tsarevich e racconta nuove voci. I bambini se ne vanno, appare la regina, piena di causticità e irritazione nei confronti del cristiano, interpretando con i bambini il "re". Il re rimane sordo alla sua richiesta di mandare via il cristiano. Semyon Godunov riferisce del rapido progresso dei traditori, del trasferimento delle truppe a loro e della resistenza testarda di Basmanov. Vasily Shuisky offre a Boris di andare lui stesso alle truppe o di chiamare la regina vedova per testimoniare la morte di suo figlio. Avendo ordinato a Shuisky di strappare le lingue a coloro che diffondevano voci, Boris manda Dimitry a chiamare sua madre. Nella casa di Fedor Nikitich Romanov, i boyar Romanovs, Sitsky, Repnin e Cherkassky bevono per il principe. Arriva Shuisky, riferisce dell'ordine di Boris, viene interrogato sulla sua ricerca in Uglic, risponde vagamente. Semyon Godunov con gli arcieri, avendo accusato il pubblico di voler avvelenare il sovrano con il veleno, prende tutti in custodia, equipaggiando Vasily Shuisky per condurre un interrogatorio. Boris, riflettendo da solo su una previsione compiuta ("Ucciso, ma vivo"), che venne a Shuisky ordinò di dichiarare in prima linea che lui stesso aveva visto il cadavere dello zar a Uglich. Nel frattempo, i consiglieri spingono Christian, spiegando che dovrebbe rifiutare di sposare Xenia, che Boris si è tradito con paura, che Ksenia è la figlia di un cattivo e di una domestica. Christian, sentendo la stordimento avvicinarsi, credere nella colpa di Boris, non sa cosa decidere. Ksenia arriva e lui, confuso in parole e pensieri, parla dell'inevitabile separazione, e poi la chiama a scappare da lui dal padre assassino. Fyodor, che è entrato in silenzio, difende suo padre, stanno per combattere, Ksenia, piangendo, ricorda il giuramento reciproco. Christian rave e, considerandolo malato, Ksenia e Fedor lo portano via.
Sulla Piazza Rossa, i detective ascoltano le conversazioni tra persone che camminano dal requiem di Tsarevich Dimitri (lì fu proclamato l'anatema di Grishka). Provocando, interpretando il discorso in un modo adatto a loro, i detective afferrano quasi tutti di fila. Vasily Shuisky del Luogo di esecuzione fa un discorso ambiguo sul nemico in progresso e parla della ricerca in Uglich in modo che non sia chiaro chi fosse il bambino assassinato. In questo periodo, la madre del principe, portata dal monastero, ora la suora Marta, in attesa di Boris e in cerca di vendetta, decide di riconoscere l'impostore come figlio; dice che non ha visto suo figlio morto, avendo perso i sentimenti, e al servizio funebre le hanno coperto gli occhi. Ora, dopo aver sentito parlare dei segni dello Tsarevich che è apparso, ammette di essere stato miracolosamente salvato e vivo. Tsaritsa Maria Grigoryevna, volendo condannare l'inganno, presenta Volokhov. Il dolore che afferrò Martha alla vista dell'assassino di suo figlio la tradisce, ma lei rifiuta di ammettere pubblicamente la morte di Demetrio. Presto il dottore riferisce a Boris del deterioramento della salute di Christian e della sua impotenza. Semyon Godunov porta una lettera di Dimitry Ioannovich, in cui Boris è più depresso della misericordia promessa in caso di abdicazione volontaria del trono, e quindi della fiducia del ladro nel supporto universale. Boris chiede di portare un Kleshnin a pelo corto per essere sicuro della morte del principe. Si chiama Christian e presto informa Xenia e Fedor della sua morte.
Due sentinelle, portando una guardia notturna nella sala del trono, si nascondono nella paura quando appare Boris insonne. Qualcuno immagina l'immagine di qualcuno sul trono e, trovando le sentinelle, le manda a controllare chi è seduto lì. Semyon Godunov porta Kleshnin, che conferma la morte di Demetrio, ricorda che il termine del regno di Borisov, previsto dai Magi, sta per finire, lo invita a pentirsi e partire per il monastero. Al mattino, dopo aver ricevuto da Basmanov che sono arrivate informazioni su una parziale vittoria sul "ladro", Boris racconta a Fedor della necessità di sposarsi con il trono e del giuramento a cui saranno condotti i boyar. Fedor abbandona il trono, poiché non è sicuro che il "ladro" non sia Demetrio. Boris offre in modo significativo a presentare a Fedor le prove indiscutibili della morte di Tsarevich, e lui, avendo compreso il crimine di suo padre, rifiuta in modo inorridito le prove e dichiara che accetterà la corona. Nella sala da pranzo, aspettando Basmanov e lo zar, i boia maledicono entrambi e scambiano notizie sul "principe". Entra Basmanov, lamentandosi della sua scomunica scomunica. Boris appare con i bambini. Boris premia Basmanov. I boia, notando la tristezza di Xenia, la compatiscono e si chiedono che cosa fare di lei, "quando verrà nel regno". Boris richiede un giuramento di fedeltà a Fedor e l'approvazione di questo giuramento nella cattedrale, perde forza e cade. Con confusione generale, dichiara che la causa della sua morte non è il veleno, ma il dolore, lascia in eredità ai boiardi di mantenere un giuramento, ricorda che "solo il male nascerà dal male" e, dichiarando Fedor King, parte