XVIII secolo. Nella taverna "Admiral Benbow", situata vicino alla città inglese di Bristol, si insedia un misterioso sconosciuto - un uomo anziano in sovrappeso con una cicatrice a sciabola sulla guancia. Si chiama Billy Bones. Scortese e sfrenato, ha chiaramente paura di qualcuno allo stesso tempo, e chiede persino al figlio dei proprietari della locanda, Jim Hawkins, di vedere se un marinaio appare su una gamba di legno nella zona.
Alla fine, quelli da cui si nasconde Billy Bones lo trovano; il primo intruso, un uomo dalla faccia pallida e terrosa, si chiama Black Dog. Scoppia una lite tra Billy Bons e il Cane nero, e il Cane nero, ferito alla spalla, fugge. Dall'eccitazione provata con Billy Bones, si verifica un colpo di apoplessia. A letto per diversi giorni, confessa a Jim di essere stato il navigatore del defunto capitano Flint, l'illustre pirata il cui nome aveva recentemente terrorizzato i marinai. Il vecchio navigatore teme che i suoi ex complici, che stanno cercando il contenuto del suo petto da marinaio, gli invieranno un segno nero - un segno di avvertimento da pirata.
È questo che succede. È portato da un cieco dall'aspetto ripugnante di nome Pugh. Quando se ne va, Billy Bones sta per scappare, ma il suo cuore dolorante non lo sopporta e muore. Rendendosi conto che i rapinatori di mare sarebbero presto entrati nella taverna, Jim e sua madre mandarono degli altri abitanti del villaggio in cerca di aiuto, e tornarono a prendere i soldi dal forziere del pirata morto a causa loro per la fatturazione. Insieme ai soldi, Jim prende una borsa dal petto.
Non appena un giovane con sua madre ha il tempo di uscire di casa, quando ci sono pirati che non riescono a trovare quello che stanno cercando. Le guardie doganali galoppano lungo la strada e i ladri devono uscire. E il cieco Pugh, lanciato dai complici, cade sotto gli zoccoli del cavallo.
Nel pacchetto che Jim consegna a due rispettabili signori, il dott. Livesey e Squire (titolo nobiliare inglese) Trelawney, c'è una mappa dell'isola dove sono nascosti i tesori del Capitano Flint. I signori decidono di seguirli, prendendo Jim Hawkins da giovane sulla nave. Avendo promesso al medico di non dedicare nessuno ai fini del prossimo viaggio, lo scudiero Trelawney parte per Bristol per acquistare una nave e assumere un equipaggio. Successivamente, si scopre che lo scudiero non ha mantenuto la parola: l'intera città sa dove e perché la goletta Hispaniola salperà.
Alla squadra che ha reclutato non piace il capitano Smollett assunto da lui, che pensa che i marinai non siano abbastanza affidabili. La maggior parte di loro è stata raccomandata dal proprietario della taverna Spyglass da John Silver con una gamba sola. Lo stesso ex marinaio, viene assunto come nave da coca. Poco prima di salpare, Jim incontra nella sua taverna il Cane Nero, che, dopo aver visto il giovane, scappa. Il dottore e lo scudiero apprendono questo episodio, ma non attribuiscono alcuna importanza ad esso.
Tutto risulta quando la "Hispaniola" sta già salpando per l'isola del tesoro. Salendo nella botte di mele, Jim sente accidentalmente Silver parlare ai marinai, da cui apprende che la maggior parte di loro sono pirati, e il loro capo è il cuoco con una gamba sola, che era il quartier generale del Capitano Flint. Il loro piano è, dopo aver scoperto i tesori e averli consegnati a bordo della nave, uccidere tutte le persone oneste sulla nave. Jim informa gli amici di ciò che ha sentito e accettano un ulteriore piano d'azione.
Non appena la goletta si ancora sull'isola, la disciplina sulla nave inizia a precipitare. La rivolta sta producendo. Questo è in contrasto con il piano di Silver, e il Capitano Smollett gli dà l'opportunità di calmare la squadra parlando con i marinai faccia a faccia. Il capitano li invita a rilassarsi sulla spiaggia e, prima del tramonto, ritorna sulla nave. Lasciando complici sulla goletta, i pirati, guidati da Silver, partirono in barca per l'isola. Non è chiaro il perché, Jim salta su una delle barche, che, tuttavia, scappa non appena arriva a terra. Girovagando per l'isola, Jim incontra Ben Gunn, un ex pirata che è stato lasciato qui dai suoi compagni tre anni fa. Ha pagato per convincerli a cercare i tesori del Capitano Flint, che non hanno avuto successo. Ben Gunn afferma che è più probabile che aiuti i signori nati naturali che i signori della fortuna, e chiede a Jim di trasmetterlo agli amici. Inoltre dice al giovane che ha una barca e spiega come trovarla.
In quel momento, il capitano, il dottore, lo scudiero con tre servi e il marinaio Abe Gray, che non voleva stare con i pirati, riesce a fuggire dalla nave in uno scafo, portando con sé armi, munizioni e provviste. Si rifugiano in una casa di tronchi dietro una staccionata, dove scorre un ruscello e puoi tenere un assedio a lungo. Vedendo la bandiera britannica sopra la staccionata, e non il Jolly Roger che i pirati avrebbero sollevato, Jim Hawkins si rende conto che ci sono amici e, unendosi a loro, parla di Ben Gann.
Dopo che la piccola guarnigione coraggiosa respinge l'attacco dei pirati che cercano di impossessarsi della mappa del tesoro, il dottor Livesey si incontra con Ben Gunn e Jim commette un nuovo atto inspiegabile. Lascia il forte senza permesso, cerca una barca appartenente a Ben Gann e parte per la "Hispaniola". Approfittando del fatto che poco prima della sua apparizione, i due pirati che la sorvegliavano inscenarono una rissa da ubriachi in cui uno di loro morì e l'altro fu ferito, Jim afferra la nave e lo porta in una baia isolata, dopo di che ritorna al forte.
Ma non trova lì i suoi amici, ma risulta essere nelle mani dei pirati, ai quali, come scoprirà in seguito, il forte fu dato senza combattere. Vogliono già dare una morte dolorosa al giovane, quando all'improvviso John Silver lo difende. Diventa chiaro che il leader dei ladri a quel tempo capisce già che il gioco è perso e, proteggendo Jim, sta cercando di salvare la propria pelle. Ciò è confermato quando il dottor Livesey arriva al forte, che dà a Silver la sua ambita carta, e l'ex cuoco riceve una promessa da lui per salvarlo dalla forca.
Quando i ladri di mare arrivano nel luogo in cui, come mostra la mappa, i tesori vengono sepolti, trovano un buco vuoto e stanno per fare a pezzi il loro capo, e con esso il ragazzo, quando i colpi vengono sparati e due di loro cadono morti, il resto inizia al mattino. Il dottor Livesey, il marinaio Abe Gray e Ben Gunn, che sono venuti in aiuto, portano Jim e Silver nella caverna, dove lo scudiero e il capitano li stanno aspettando. Si scopre che Ben Gunn aveva da tempo trovato l'oro di Flint e l'aveva trascinato nella sua casa.
Dopo aver caricato i tesori sulla nave, tutti fanno il viaggio di ritorno, lasciando i pirati su un'isola deserta. L'argento fugge in uno dei porti d'America afferrando una borsa di monete d'oro. Il resto raggiunge tranquillamente la costa dell'Inghilterra, dove ognuno ottiene la sua parte di tesoro.